Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef12Q9D2F1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms