Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spc24Q9D083 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spc24Q9D083 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms