Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CYI0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CYI0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CYI0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms