Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrc17Q9CXD9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms