Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Cnot11Q9CWN7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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