Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Fcf1Q9CTH6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Fcf1Q9CTH6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Fcf1Q9CTH6 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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