Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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