Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PompQ9CQT5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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PompQ9CQT5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PompQ9CQT5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms