Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Mrpl35Q9CQL6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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