Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms