Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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