Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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