Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GpnmbQ99P91 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms