Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Sf3b1Q99NB9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Sf3b1Q99NB9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Sf3b1Q99NB9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Sf3b1Q99NB9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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