Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl3Q99N95 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl3Q99N95 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl3Q99N95 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl3Q99N95 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl3Q99N95 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl3Q99N95 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl3Q99N95 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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