Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tdrd1Q99MV1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tdrd1Q99MV1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tdrd1Q99MV1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tdrd1Q99MV1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tdrd1Q99MV1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tdrd1Q99MV1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tdrd1Q99MV1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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