Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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SrrtQ99MR6 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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SrrtQ99MR6 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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