Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms