Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Nus1Q99LJ8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Nus1Q99LJ8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Nus1Q99LJ8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms