Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Sh3bp5lQ99LH9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Sh3bp5lQ99LH9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms