Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms