Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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