Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Def8Q99J78 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms