Protein–RNA interactions for Protein: Q923W1

Tgs1, Trimethylguanosine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgs1Q923W1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgs1Q923W1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms