Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms