Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3bQ91ZU9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3bQ91ZU9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3bQ91ZU9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3bQ91ZU9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3bQ91ZU9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3bQ91ZU9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3bQ91ZU9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3bQ91ZU9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3bQ91ZU9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3bQ91ZU9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3bQ91ZU9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3bQ91ZU9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3bQ91ZU9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3bQ91ZU9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3bQ91ZU9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.3 ms