Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx18Q91ZR2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms