Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhb12Q91Y07 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms