Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms