Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms