Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms