Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms