Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ubxn4Q8VCH8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ubxn4Q8VCH8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms