Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms