Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Vmn1r200Q8R281 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Vmn1r200Q8R281 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Vmn1r200Q8R281 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Vmn1r200Q8R281 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Vmn1r200Q8R281 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Vmn1r200Q8R281 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r200Q8R281 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Vmn1r200Q8R281 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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