Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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