Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms