Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Vrk3Q8K3G5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Vrk3Q8K3G5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Vrk3Q8K3G5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Vrk3Q8K3G5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Vrk3Q8K3G5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Vrk3Q8K3G5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Vrk3Q8K3G5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Vrk3Q8K3G5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Vrk3Q8K3G5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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