Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms