Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c1Q8K284 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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