Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Trim68Q8K243 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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