Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Nek9Q8K1R7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Nek9Q8K1R7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Nek9Q8K1R7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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