Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms