Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms