Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms