Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms