Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf20l1Q8CCJ9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms