Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Usp20Q8C6M1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Usp20Q8C6M1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp20Q8C6M1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp20Q8C6M1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp20Q8C6M1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp20Q8C6M1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp20Q8C6M1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp20Q8C6M1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp20Q8C6M1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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