Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms