Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Smarcal1Q8BJL0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Smarcal1Q8BJL0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Smarcal1Q8BJL0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Smarcal1Q8BJL0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Smarcal1Q8BJL0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Smarcal1Q8BJL0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Smarcal1Q8BJL0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Smarcal1Q8BJL0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Smarcal1Q8BJL0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Smarcal1Q8BJL0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Smarcal1Q8BJL0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Smarcal1Q8BJL0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Smarcal1Q8BJL0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Smarcal1Q8BJL0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Smarcal1Q8BJL0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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